敲除CTLA-4可以提高CAR-T细胞抗肿瘤疗效
在机制上,CTLA-4缺失允许CD28的信号传导,并可维持T细胞表面的 CAR 表达。在临床研究中,CTLA-4的缺失挽救了以前CAR-T治疗失败的白血病患者的T细胞功能。因此,CTLA-4的选择性缺失使功能失调的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者的T细胞重新活跃,为增加患者对CAR-T细胞治疗的反应提供了一种新的策略。 为了评估CRISPR/Cas9介导的PD-1和CTLA-4检查点受体缺失是否可以提高靶向CD19的嵌合抗原受体T细胞(CART19)的疗效,他们制备了人源化的CART19细胞进行实验。在确保有效敲除的基础上,他们发现PD-1和/或CTLA-4缺失的CART19细胞表现出类似的增殖能力、记忆表型、抑制受体水平和表面CAR表达。同样地,WT和编辑过的CART19细胞显示出同等水平的细胞毒活性、脱颗粒能力等。 为了确定是否缺失PD-1和/或CTLA-4可以预防或延迟CAR-T功能障碍,他们开发了一种使用慢性抗原暴露(CAE)的体外应激试验。结果发现,与PD-1缺陷的CART19细胞和PD-1/CTLA-4均缺陷的CART19细胞相比,CTLA-4 缺陷的CART19细胞表现出双倍扩增能力和抗肿瘤功效增强。
在进一步的应激测试中,与WT、PD-1缺陷的CART19细胞和 PD-1/CTLA-4均缺陷的CART19细胞相比,CTLA-4缺陷的CART19细胞分泌的GM-CSF、IL-13和CCL5水平增加。在CAE刺激条件下,CTLA-4缺陷的CART19细胞都比WT细胞表现出更高的扩增能力和肿瘤清除能力。
为了研究驱动CTLA-4缺失CAR-T细胞提高抗肿瘤疗效的分子途径,他们对CAE刺激后第0天和第15天的WT和CTLA-4缺失CAR-T细胞进行了单细胞转录组测序 (scRNA-seq)。为了深入了解CTLA-4的缺失如何影响T细胞的广泛分布,他们绘制了每个亚群中的相对细胞数量。有趣的是,在第15天,与WT CART19细胞相比,CTLA-4缺失的CART19细胞在增殖亚群中的细胞比例更高,而在终末效应亚群、应激亚群和凋亡亚群中的细胞比例更低。这些数据提供了关于CTLA-4缺失CAR-T细胞如何优于WT CAR-T细胞的见解。为了从体外应激功能障碍模型中识别功能障碍基因,他们在CAE刺激后第0天和第15天测定了差异表达基因。他们观察到了衰竭基因的上调,如CTLA-4、HAVCR2、LAG-3、KLRD1、IL-2RA、ENTPD1、GNLY、LAYN、CCL3、CCL4、TNFRSF18 和DUSP4。
为了从机制上理解CTLA-4缺失如何促进白血病患者CAR-T细胞在应激测试后抗肿瘤疗效的提高,他们鉴定并比较了来自ND和CLL CAR-T细胞的WT和CTLA-4缺失细胞的DEGs。在CTLA-4缺失的ND和CLL CAR-T 细胞中有许多常见的上调通路,糖酵解是唯一被下调的通路。在应激测试后的ND和CLL CTLA-4缺失CAR-T细胞中,参与细胞周期调控的通路也出现在上调的通路中。这表明,在CAR-T细胞中缺失免疫检查点CTLA-4促进了T细胞的扩增。
他们进一步在WT和CTLA-4缺陷的ND和CLL CAR-T细胞中检测了CD28下游靶点的表达。CTLA-4缺失CAR-T细胞显示GZMB、IL-2RA和 CDK6的上调,这些基因有助于更好的增殖和发挥效应功能。此外,与WT CART19细胞相比,CTLA-4缺失CAR-T细胞的CD28共刺激水平增强。这也在异种移植小鼠模型中得到了重现,即与WT CLL CAR-T细胞相比,CTLA-4缺陷小鼠的外周血CAR-T细胞中检测到细胞表面CD28的表达增加。基于这些数据,他们提出,CTLA-4在CAR-T细胞中的缺失导致了CD28信号的增强,从而维持了CAR-T细胞的共刺激和减少了CAR-T细胞功能障碍,这共同提高了CAR-T细胞的效应功能,增加了其增殖,并维持了细胞表面CAR的表达。
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